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Pierre-Alexis Geoffroy est professeur de médecine à l'Université Paris-Cité, responsable du Centre ChronoS (Psychiatrie, Chronobiologie et Sommeil) et responsable adjoint du secteur de psychiatrie adulte 75G22, au GHU Paris Psychiatrie Neurosciences.
Il est également responsable adjoint du département de psychiatrie et d'addictologie à l'Assistance Publique Hôpitaux de Paris (AP-HP) à l'hôpital Bichat et Beaujon, président du Collège National des Renseignants de Médecine du Sommeil (CNESom) et directeur scientifique du Tiers-lieu MindLink (E-santé) du GHU Paris Psychiatrie Neurosciences.
Enfin, il opère en tant que chercheur en neurosciences au sein de l'unité NeuroDiderot Inserm U1141, équipe Sleep CMD, et porte un axe de recherche sur les biomarqueurs du sommeil et des rythmes circadiens dans les troubles de l’humeur, avec plus de 250 publications scientifiques dans des journaux à comité de relecture.