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Après avoir débuté sa carrière d’économiste à l’Institut français des relations internationales (IFRI), Marie-Hélène Duprat a travaillé en tant qu’économiste au Crédit National (devenu Natixis), au Fonds monétaire international (FMI) et à la Banque mondiale. Elle a exercé diverses responsabilités au sein du Groupe Société Générale et est titulaire d'un doctorat en économie de l'université Paris 1 Panthéon-Sorbonne et est diplômée de Sciences Po Paris. Marie-Hélène a également été chercheur invitée au Massachusetts Institute of Technology (MIT).