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Les principales activités de recherche de Johnny Deschamps concernent la production d'hydrogène vert à partir de biomasse, le stockage d'hydrogène par adsorption dans des matériaux poreux de type organic frameworks, les matériaux énergétiques et le confinement de fluides et de métaux dans des matériaux poreux. Il développe des techniques originales de dopage de matériaux type organic frameworks au moyen de matériaux carbonés et de métaux et il enseigne ''la filière hydrogène" dans plusieurs institutions prestigieuses en France et en Chine.