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Après des études de physique théorique à l’université d’Orsay et l’École Normale Supérieure (ENS) de Cachan, Jérôme Ogée a poursuivi ses études par un diplôme d’étude approfondi (DEA, ex-master recherche) en météorologie et océanographie à l’université de Toulouse, puis un doctorat en bioclimatogie, également à l’université de Toulouse. Après sa thèse, il a travaillé comme chercheur contractuel au Laboratoire des sciences du climat et de l’environnement (LSCE), puis a été recruté à l'Inra (maintenant Inrae) en 2004 pour travailler sur les interactions entre climat et végétation, où il est encore. Au cours de son parcours universitaire et professionnel, il a également exercé à l'étranger, à l’université Trinity College de Dublin (4 mois), à l’université de Berkeley en Californie (1 an) et à l’université de Cambridge en Angleterre (1 an).